研究は主に以下の6つのグループによって構成されています。
[ 角膜グループ ] [ 感染症グループ ] [ アレルギーグループ ]
[ 緑内障グループ ] [ 網膜硝子体グループ ] [ 小児眼科グループ ]

 ■角膜グループ
・角膜移植の拒絶反応に関わる涙液サイトカインの経時的動態の研究
・角膜移植の拒絶反応を低下させる免疫抑制薬の臨床薬理学的解析
・重症角膜感染症に対する治療的角膜移植の治療成績の研究
・翼状片の再発に関する要因と病態の研究
　
■感染症グループ
・アデノウイルス角結膜炎の治療薬に関する探索的研究
・アデノウイルス角結膜炎の局所潜伏感染に関するウイルス学的解析
・アデノウイルス角結膜炎の型間における角膜上皮細胞への接着性の比較解析
・角膜真菌症の薬物治療における薬理学的研究
 
■アレルギーグループ
・春季カタル・アトピー性角結膜炎の病態生理，特に再発に関わる因子の免疫学的研究
・春季カタルに対する免疫抑制点眼薬の投与法の新しい開発
・黄砂，PM2.5等のエアロゾルの角膜立体モデルを用いた免疫学的・病理学的解析
 
■緑内障グループ
・血管新生緑内障の発症，治療に関する生化学的研究
・眼内充填物質とそれに関連した緑内障に関する解析
 
■網膜硝子体グループ
・抗TGF抗体治療による網膜硝子体疾患の治療効果を光線力学療法との関連から解析する研究
・網膜血管新生に関わる硝子体サイトカインの解析
・遺伝性網膜疾患に対する候補遺伝子解析，原因蛋白の構造と機能の同定を進め，将来の遺伝子治療を目指す研究（近藤寛之教授との共同研究）
 
■小児眼科グループ
・未熟児網膜症の発症と抑制に関する抗TGF抗体治療の関連の研究